| 1974 | Concert Royaux, Nouveaux Concerts, L'Apothéose de Corelli, L'Apothéose de Lully, Sonatas "La Superbe", "La Steinquerque", "La Sultane" | François Couperin; Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken& Bart Kuijken | | 1 |
| 1974 | Sonaten für violine & Cembalo no. 1-6, BWV 1014-1019 | Johann Sebastian Bach; Sigiswald Kuijken, Gustav Leonhardt | | 3 |
| 1979 | Six Trios op. 38 for Transverse Flute, Violin and Violoncello | Joseph Haydn; Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken | | 2 |
| 1980 | Die Brandenburgische Konzerte | J. S. Bach; Brüggen, Kuijken, Bylsma, Leonhardt | | 4 |
| 1980 | Le Quattro Stagioni • Die Vier Jahreszeiten • The Four Seasons • Les Quatre Saisons | Antonio Vivaldi; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1982 | Konzerte für Violine a-moll BWV 1041 und E-dur BWV 1042 / Konzert für zwei Violinen d-moll BWV 1043 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1982 | Orfeo ed Euridice | Christoph Willibald Gluck; Marianne Kweksilber, René Jacobs, Magdalena Falewicz, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken, Collegium Vocale | | 2 |
| 1982 | The Flute Quartets | Wolfgang Amadeus Mozart; Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Lucy van Dael, Wieland Kuijken | | 3 |
| 1983 | Sonatas & Partitas BWV 1001-1006 | Johann Sebastian Bach; Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1984 | Telemann - Suite in G minor from "Getreue Music-Meister"; Sonata in B major from "Esserzicii musici"; Partita II in G major from "Die kleine Cammer-Music"; Sonata in G minor from "Music de Table" | Georg Philipp Telemann; Paul Dombrecht, Sigiswald Kuijken, Robert Kohnen | | 1 |
| 1985 | Musical Offering | Bach; Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken, Robert Kohnen, Gustav Leonhardt | | 1 |
| 1986 | Requiem in D minor, KV. 626 | Wolfgang Amadeus Mozart; Ingrid Schmithüsen, Catherine Patriasz, Neil Mackie, Matthias Hölle, La Petite Bande, Nederlands Kamerkoor, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1986 | Six Trios For Transverse Flute, Violin And Violoncello - Volume II | Joseph Haydn; Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken | | 1 |
| 1987 | Concerts Royaux | Couperin; Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken, Barthold Kuijken | | 1 |
| 1988 | Johannes-Passion, BWV 245 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1988 | Symphonies Nos. 26 "Lamentatione", 52 & 53 "L'Imperiale" | Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1989 | Concert Arias | Mozart; Lena Lootens, Christoph Prégardien, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1989 | Concerts Royaux 1-4 | Couperin; Sigiswald Kuijken, Bart Kuijken, Wieland Kuijken | | 1 |
| 1989 | Magnificat BWV 243 - Cantata "Ich hatte viel Bekümmernis" BWV 21 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande,Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1989 | Symphonies No. 82 L'Ours · No. 83 La Poule · No. 84 | Haydn, Orchestra of the Age of Enlightenment, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1989 | Violinkonzerte BWV 1041-1043 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1990 | Alessandro | Haendel; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1990 | 6 Concerti Grossi | Francesco Geminiani; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1990 | Concerti Grossi Op. 6 | Corelli; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1990 | Hippolyte Et Aricie, Suite Pour Orchestre | Jean-Philippe Rameau; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1990 | Horn Concertos / Rondo, K. 371 / Fragment in E, K. 494a | Wolfgang Amadeus Mozart; Timothy Brown, Orchestra of the Age of Enlightenment, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1990 | Johannes-Passion, BWV 245 | J.S. Bach; Christoph Prégardien, Harry van der Kamp, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1990 | The Last Sufferings of the Saviour | C. Ph. E. Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 1990 | Zoroastre | Jean‐Philippe Rameau; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1991 | German Chamber Music | Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken & Robert Kohnen | | 1 |
| 1992 | La Petite Bande 20th Anniversary Vol2 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1993 | Pieces de clavecin en concerts | Jean‐Philippe Rameau; Frans Brüggen, Gustav Leonhardt, Wieland Kuijken, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1993 | London Symphonies nos. 93, 94 "The Surprise" & 95 | Joseph Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1995 | 6 Concerti Grossi, op. 6, Nos. 1 to 6 | Arcangelo Corelli; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1995 | Four Overtures for Orchestra | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 3 |
| 1995 | Musicalisches Opfer / Musical Offering BWV 1079 | Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken & Robert Kohnen | | 1 |
| 1996 | Harmoniemesse / Te Deum | J. Haydn; Piau, Groop, Prégardien, van der Kamp, Chœur de Chambre de Namur, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1997 | Don Giovanni | W.A. Mozart; Werner Van Mechelen, Huub Claessens, Elena Vink, Markus Schäfer, Nancy Argenta, Nanco de Vries, Christina Högman, Harry van der Kamp, Collegium Compostellanum, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1997 | London Symphonies nos. 103 "Mit dem Paukenwirbel" & 104 "Salomon" | Joseph Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1997 | Paris Quartets 1-12 | Georg Philipp Telemann; Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken, Gustav Leonhardt | | 1 |
| 1997 | Sonatas for Violin and Piano | Mozart; Gustav Leonhardt, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1997 | String Quintets, op. 29 | Boccherini; Bylsma, Kuijken, van Dael, Stuurop, Smith | | 1 |
| 1997 | The Royal Consort | William Lawes; Jacobs, Kuijken, Leonhardt | | 1 |
| 1999 | Cantates, BWV 82 / 49 / 58 | Johann Sebastian Bach; Nancy Argenta, Klaus Mertens, Marcel Ponseele, Hidemi Suzuki, Pierre Hantaï, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1999 | Christmas Works - Weihnachtshistorie | Schütz, Sigiswald Kuijken, La Petite Bande | | 1 |
| 1999 | Die Jahreszeiten | Joseph Haydn; Krisztina Laki, Helmut Wildhaber, Peter Lika, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 1999 | Nouveaux Concerts N° 8 & 13 / "L'Apothéose de Corelli" | Couperin; Kuijkens, Van Dael, Van Olmen, Haynes, Dombrecht, Lange, Kohnen | | 1 |
| 1999 | Trio Sonatas for Flute | Georg Philipp Telemann; Frans Brüggen, Sigiswald Kuijken, Bob van Asperen, Anner Bylsma, Gustav Leonhardt | | 1 |
| 2000 | The Paris Symphonies 82-87 | Haydn; Orchestra of the Age of Enlightenment, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2001 | Sonatas & Partitas BWV 1001-1006 | Johann Sebastian Bach; Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2003 | Die Auferstehung und Himmelfahrt Jesu | Carl Philipp Emanuel Bach; Uta Schwabe, Christoph Genz, Stephan Genz, Ex Tempore, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 2004 | Der Tod Jesu – Passion Cantata | Carl Heinrich Graun; Uta Schwabe, Inge Van de Kerkhove, Christoph Genz, Stephan Genz, La Petite Bande, Ex Tempore, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2004 | Schneider: Symphony no. 17 / Mendelssohn: Violin Concerto in D / Symphony no. 1 | Friedrich Schneider; Felix Mendelssohn-Bartholdy, Hiro Kurosaki, Cappella Coloniensis, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 2005 | Music In Versailles | Gustav Leonhardt, Sigiswald Kuijken, Wieland Kuijken | | 2 |
| 2005 | Twelve Trios for Transverse Flute, Violin & Violoncello | Joseph Haydn; Barthold Kuijken, Wieland Kuijken, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2006 | Johann Sebastian Bach: Cantatas BWV 82 - 178 - 102 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2006 | Cantatas 16 - 153 - 65 - 154 ›Sie Werden Aus Saba Alle Kommen‹ | Johann Sebastian Bach - La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2006 | Concert de danse | La Petite Bande, Sigiswald Kuijken, Howard Crook | | 1 |
| 2006 | The Sonatas for Fortepiano and Violin | Wolfgang Amadeus Mozart; Sigiswald Kuijken, Luc Devos | | 1 |
| 2007 | Bach Cello Suites | Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2007 | Le Quattro Stagioni | Antonio Vivaldi; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2007 | Symphony No. 83 in G minor "La Poule" / Symphony No. 84 in E flat minor / Symphony No. 85 in B flat major "La Reine de France | Joseph Haydn; Orchestra of the Age of Enlightenment, Sigiswald Kuijken | 5 | 1 |
| 2008 | Harpsichord Concertos in F and G / Divertimento in F | Joseph Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken, Ewald Demeyere | | 2 |
| 2008 | Cantatas BWV 61 - 36 - 62 - 132: Nun Komm Der Heiden Heiland | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2009 | Johann Sebastian Bach: h-Moll Messe / La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande & Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2009 | Brandenburg Concertos Nos. 2, 3, 4, 5 / Violin Concerto No. 1 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2009 | Cantatas BWV 13 73 81 144 | Johann Sebastian Bach; Sigiswald Kuijken & La Petite Bande | | 1 |
| 2009 | Johan Sebastian Bach: Cantatas BWV 67 - 85 - 12 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2009 | Matthäus-Passion BWV 244 | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2009 | Partenope | Händel; Krisztina Láki, René Jacobs, Helga Müller‐Molinari, John York Skinner, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2010 | Late French Viol Music | A. Forqueray, Ch. Dollé; W. Kuijken, S. Kuijken, R. Kohnen | | 1 |
| 2011 | The Brandenburg Concertos | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2011 | Die Zauberflöte | Mozart; Isolde Siebert, Suzie LeBlanc, Christoph Genz, Cornelius Hauptmann, Stephan Genz, Marie Kuijken, Philip Defrancq, Stephan Schreckenberger, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2012 | Cantata da Camera | Nicola Porpora, Antonio Caldara, George Frideric Handel; René Jacobs, Barthold Kuijken, Sigiswald Kuijken, Anner Bylsma, Gustav Leonhardt | | 1 |
| 2012 | Excerpts from: St. John Passion / Mass in B minor / St. Matthew Passion | Johann Sebastian Bach; René Jacobs, Isabelle Poulenard, Christian Fliegner, Marcus Schäfer, Klaus Mertens, La Petite Bande, Gustav Leonhardt, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2012 | Die Tageszeiten - Symphonies nos. 6, 7, 8 - Le Matin - Le Midi - Le Soir | Joseph Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2013 | Les suites d’orchestre | Johann Sebastian Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 2016 | Trumpet & Horn Concertos | Telemann - Jean-François Madeuf, Pierre-Yves Madeuf, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2017 | Piano Concertos K. 413, K. 414 & K. 415 | Wolfgang Amadeus Mozart; Marie Kuijken, Veronica Kuijken, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2018 | Das Neugeborne Kindelein | Buxtehude, Telemann, J.S. Bach; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 2 |
| 2021 | Eine kleine Nachtmusik / Divertimenti KV 136-138 | W.A. Mozart; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2022 | The Harpsichord Concertos, Vol. I | Johann Sebastian Bach; Mario Sarrechia, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2024 | Solo | Sigiswald Kuijken | | 1 |
| 2026 | Harpsichord Concertos, Vol. 2 | Johann Sebastian Bach; Mario Sarrechia, Hsiu-Tzu Ryan, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| — | Ave verum corpus, K. 618 / Davidde penitente, K. 469 | W.A. Mozart; Krisztina Laki, Nicole Fallien, Hans Peter Blochwitz, Nederlands Kamerkoor, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| — | London Symphonies nos. 101 "The Clock" & 102 | Joseph Haydn; La Petite Bande, Sigiswald Kuijken | | 1 |
| — | Sonata Partita II | Johann Sebastian Bach; Sigiswald Kuijken | | 1 |
| — | W.A. Mozart: Flötenkonzerte K 313/314; Andante K 315 | Wolfgang Amadeus Mozart, La Petite Bande, Sigiswald Kuijken & Barthold Kuijken | | 1 |